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DNA條形碼:讓中藥材鑒定擺脫經(jīng)驗依賴(lài)

作者:人民資訊     來(lái)源:百家號    2021-8-27    打印內容 打印內容

陳士林認為,相比傳統的中藥材鑒定方法,中藥材DNA條形碼鑒定技術(shù)具有多方面優(yōu)勢。

“該技術(shù)具有通用性,只需選用一個(gè)或少數幾個(gè)基因片段即可對絕大部分物種進(jìn)行準確鑒定;鑒定過(guò)程更加快速;重復性和穩定性高;實(shí)驗過(guò)程標準、操作簡(jiǎn)單;可通過(guò)互聯(lián)網(wǎng)和信息平臺對現有物種序列信息進(jìn)行集中統一管理;可有效緩解分類(lèi)鑒定人才缺乏的現狀!标愂苛终f(shuō)。

近年來(lái),DNA條形碼鑒定技術(shù)在中藥材鑒定中已得到成功應用,擺脫了傳統形態(tài)鑒定方法依賴(lài)長(cháng)期經(jīng)驗的束縛。陳士林強調,該技術(shù)有利于標準化,是中藥分子鑒定方法學(xué)上的創(chuàng )新。

不過(guò),這項鑒定技術(shù)也存在短板。陳士林解釋?zhuān)骸坝捎贒NA條形碼鑒定技術(shù)主要在核酸層面對物種進(jìn)行鑒定,不包含物種的性狀和物理化學(xué)質(zhì)量標準信息。所以,對于在炮制或加工過(guò)程中DNA降解的藥材鑒定能力有限。另外,DNA條形碼不能鑒定礦物藥材!

讓中藥材鑒定更趨標準化

近年來(lái),國內相關(guān)團隊正在推動(dòng)中藥材DNA條形碼鑒定技術(shù)體系的建立。

比如,陳士林本草基因組學(xué)團隊在大樣本量中藥材基因序列篩選研究基礎上,出版了《中國藥典中藥材DNA條形碼標準序列》和《中藥DNA條形碼分子鑒定》,建立了中藥材DNA條形碼分子鑒定體系。

“該體系包括以ITS2+psbA-trnH為主體的植物類(lèi)藥材DNA條形碼鑒定體系和COI+ITS2的動(dòng)物類(lèi)藥材DNA條形碼鑒定體系!标愂苛纸榻B。

2010年,陳士林團隊比較了7個(gè)候選DNA條形碼,篩選的標準包括PCR擴增效率、種內/種間遺傳變異等。通過(guò)對7個(gè)門(mén)753個(gè)屬4800個(gè)物種6600多個(gè)樣品的ITS2序列鑒定能力進(jìn)行分析,顯示ITS2在物種水平的鑒定效率高達92.7%。

因此,陳士林團隊建議將ITS2作為藥用植物標準DNA條形碼,同時(shí)建議ITS2可作為新的通用條形碼用于鑒定更廣泛的植物類(lèi)群。2011年,中國DNA條形碼植物工作組對來(lái)自75科141屬1757物種6286樣本的4個(gè)DNA條形碼進(jìn)行研究,建議把ITS/ITS2作為種子植物的核心條形碼。

為了保證鑒定結果的準確性,陳士林團隊還建立了DNA條形碼數據庫。DNA條形碼數據庫不僅是存儲樣品信息和DNA條形碼序列的工具,而且是DNA條形碼研究和物種鑒定分析的生物信息學(xué)平臺,對推進(jìn)中藥材鑒定方法通用化、標準化和國際化具有重要作用。

在研究基礎上,陳士林團隊建立了中藥材DNA條形碼鑒定系統,核心數據庫涵蓋了《中國藥典》(2010年版,2015年版)收錄的幾乎所有動(dòng)物、植物藥材及常見(jiàn)混偽品,并包含了《韓國藥典》《日本藥局方》《印度藥典》《歐洲藥典》以及《美國藥典》所記錄的草藥藥材,擴展數據庫中涵蓋的物種數超過(guò)十萬(wàn)種,序列超過(guò)百萬(wàn)條。

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