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行業(yè)動(dòng)態(tài)

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基因測序攜大數據打通上下游

作者:佚名     來(lái)源:醫藥網(wǎng)    2017-7-28    打印內容 打印內容

橫向資源協(xié)調合作

創(chuàng )新制造以智能化為典型特征,要求中國醫藥企業(yè)以新技術(shù)提升運營(yíng)效率。精準醫療是未來(lái)醫療行業(yè)的發(fā)展趨勢,而精準醫療發(fā)展必須依托大數據平臺,因為平臺運營(yíng)與數據服務(wù)是生物醫療產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重要環(huán)節,基礎設施供應商合作并采用聯(lián)合運營(yíng)的方式,才能為醫療機構、測序企業(yè)等數據提供方企業(yè)提供產(chǎn)業(yè)支持保障。

值得關(guān)注的是,從生命大數據提供方企業(yè)的角度,包括華大基因、諾禾致源、金域檢驗、藥明康德、達安基因等,數據都需要“存、管、算、察”的強大核心功能支撐,以實(shí)現數據空間分布式存儲應用,解決存儲空間和數據持久化、數據解耦、分級部署、數據發(fā)現、動(dòng)態(tài)重組、信息分析調度、跨集群分布式計算等復雜性問(wèn)題。

隨著(zhù)人類(lèi)基因組測序成本以“超摩爾定律”速度下降,與之相匹配的基因組數據分析成本也在下降,尤其是在2016年至今,短短一年,基因數據分析成本的下降速度遠遠超過(guò)了基因測序成本下降的速度,F在,單個(gè)人的全基因組數據分析成本已經(jīng)降低至100元人民幣以?xún)取?/p>

基因大數據分析包括十幾個(gè)步驟,如果每個(gè)企業(yè)做數據分析面對不同的步驟選擇差異化方法,如何來(lái)組織不同的工具更優(yōu)地高效分配計算任務(wù),這是目前整個(gè)基因測序、云計算、器械設備研發(fā)等軟硬件企業(yè)都在致力于優(yōu)化的戰略性工作。北京聚道科技(GeneDock)有限公司CEO李夏戎指出,不僅需要每個(gè)企業(yè)聚焦自身的底層數據優(yōu)化,還需要產(chǎn)業(yè)鏈橫向跨步驟協(xié)同!鞍℅ATK算法優(yōu)化,加速計算運轉過(guò)程,減少CPU開(kāi)銷(xiāo),并且同產(chǎn)業(yè)鏈合作伙伴一同將技術(shù)封裝,制定數據壓縮、存儲方案;基因測序公司也需要將數據調整成分布式,從而協(xié)同開(kāi)發(fā)更加易用的操作流程!

華大基因CEO尹燁表示,檢測成本下降,如今已不是單個(gè)公司憑技術(shù)挖掘就可以解決的,“從上游醫療器械設備廠(chǎng)商,到中游基因測序企業(yè),再到下游健康服務(wù)平臺,基因檢測產(chǎn)業(yè)基于生命大數據各環(huán)必須共有、共為、共享;全行業(yè)預計到2020年能夠將單個(gè)人的全基因組測序和分析總費用控制在2000元人民幣以?xún),數據分析流程標準化和費用快速下降,將有望提前實(shí)現行業(yè)預期!

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